Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr4P51680 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr4P51680 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms