Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1swP51491 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1swP51491 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms