Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdkn1cP49919 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms