Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cav1P49817 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cav1P49817 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cav1P49817 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cav1P49817 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms