Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtpreP49446 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpreP49446 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpreP49446 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpreP49446 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms