Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpdP49429 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpdP49429 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpdP49429 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpdP49429 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpdP49429 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpdP49429 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HpdP49429 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HpdP49429 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HpdP49429 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HpdP49429 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpdP49429 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpdP49429 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpdP49429 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpdP49429 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HpdP49429 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpdP49429 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpdP49429 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpdP49429 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpdP49429 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpdP49429 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpdP49429 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpdP49429 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpdP49429 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpdP49429 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpdP49429 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms