Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbp3P49194 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms