Protein–RNA interactions for Protein: P48997

Ivl, Involucrin, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IvlP48997 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IvlP48997 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IvlP48997 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IvlP48997 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IvlP48997 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IvlP48997 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IvlP48997 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IvlP48997 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IvlP48997 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IvlP48997 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IvlP48997 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IvlP48997 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IvlP48997 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IvlP48997 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IvlP48997 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IvlP48997 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IvlP48997 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IvlP48997 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IvlP48997 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IvlP48997 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IvlP48997 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IvlP48997 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IvlP48997 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IvlP48997 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IvlP48997 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IvlP48997 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IvlP48997 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IvlP48997 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IvlP48997 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IvlP48997 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms