Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbr1P48758 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbr1P48758 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbr1P48758 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms