Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TbcaP48428 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TbcaP48428 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TbcaP48428 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TbcaP48428 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TbcaP48428 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TbcaP48428 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TbcaP48428 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TbcaP48428 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TbcaP48428 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TbcaP48428 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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