Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx2P48379 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms