Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbx2P48031 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322.8 ms