Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax9P47242 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms