Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syt1P46096 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syt1P46096 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syt1P46096 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syt1P46096 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syt1P46096 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms