Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgavP43406 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgavP43406 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms