Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec3bP43025 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec3bP43025 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms