Protein–RNA interactions for Protein: P42228

Stat4, Signal transducer and activator of transcription 4, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stat4P42228 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stat4P42228 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stat4P42228 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stat4P42228 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stat4P42228 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms