Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx1P41778 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx1P41778 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms