Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox7P40646 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox7P40646 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox7P40646 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox7P40646 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms