Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6dP35459 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly6dP35459 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms