Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Saa4P31532 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms