Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcdP28867 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms