Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxraP28700 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxraP28700 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxraP28700 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxraP28700 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxraP28700 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RxraP28700 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RxraP28700 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxraP28700 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RxraP28700 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxraP28700 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxraP28700 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxraP28700 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxraP28700 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxraP28700 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxraP28700 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxraP28700 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxraP28700 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RxraP28700 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RxraP28700 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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