Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lef1P27782 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms