Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NdnP25233 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NdnP25233 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NdnP25233 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NdnP25233 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NdnP25233 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms