Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RarbP22605 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RarbP22605 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RarbP22605 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RarbP22605 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RarbP22605 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RarbP22605 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RarbP22605 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RarbP22605 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RarbP22605 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RarbP22605 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RarbP22605 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RarbP22605 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RarbP22605 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RarbP22605 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RarbP22605 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RarbP22605 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RarbP22605 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RarbP22605 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RarbP22605 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RarbP22605 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RarbP22605 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RarbP22605 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RarbP22605 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RarbP22605 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RarbP22605 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RarbP22605 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RarbP22605 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms