Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P20040 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P20040 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P20040 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P20040 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P20040 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P20040 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P20040 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P20040 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P20040 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P20040 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P20040 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P20040 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P20040 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P20040 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P20040 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P20040 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P20040 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms