Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18530 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18530 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18530 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18530 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18530 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18530 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18530 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18530 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18530 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18530 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms