Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rag1P15919 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rag1P15919 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms