Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms