Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms