Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtcP11725 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtcP11725 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtcP11725 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtcP11725 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtcP11725 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtcP11725 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtcP11725 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtcP11725 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtcP11725 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OtcP11725 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OtcP11725 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtcP11725 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtcP11725 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtcP11725 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtcP11725 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtcP11725 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtcP11725 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtcP11725 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtcP11725 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtcP11725 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtcP11725 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtcP11725 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtcP11725 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtcP11725 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtcP11725 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtcP11725 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms