Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb4P10284 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb4P10284 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb4P10284 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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