Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Myod1P10085 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Myod1P10085 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms