Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UbbP0CG49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms