Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc9P09633 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc9P09633 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms