Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb8P09632 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb8P09632 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms