Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms