Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc8P09025 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms