Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P06321 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P06321 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06321 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P06321 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06321 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P06321 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P06321 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P06321 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P06321 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P06321 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06321 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06321 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06321 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06321 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06321 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06321 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06321 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms