Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-K1P01901 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-K1P01901 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-K1P01901 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms