Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01812 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01812 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01812 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01812 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01812 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01812 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01812 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01812 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01812 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01812 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01812 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01812 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01812 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms