Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01741 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01741 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01741 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01741 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01741 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01741 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01741 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01741 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01741 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01741 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01741 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01741 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01741 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01741 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01741 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01741 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms