Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01728 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01728 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01728 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01728 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01728 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01728 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01728 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01728 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01728 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01728 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01728 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01728 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01728 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01728 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms