Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01649 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01649 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01649 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01649 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01649 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01649 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01649 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01649 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01649 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01649 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01649 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms