Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01636 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01636 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01636 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01636 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01636 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01636 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01636 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01636 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01636 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01636 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01636 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01636 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01636 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01636 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01636 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01636 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01636 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01636 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01636 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P01636 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01636 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms