Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apba3O88888 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms