Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1O88746 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1O88746 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tom1O88746 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tom1O88746 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1O88746 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tom1O88746 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1O88746 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1O88746 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1O88746 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1O88746 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1O88746 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1O88746 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1O88746 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms