Protein–RNA interactions for Protein: O88597

Becn1, Beclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn1O88597 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Becn1O88597 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Becn1O88597 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Becn1O88597 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms