Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrp6O88572 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrp6O88572 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrp6O88572 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrp6O88572 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp6O88572 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lrp6O88572 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrp6O88572 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrp6O88572 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrp6O88572 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrp6O88572 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lrp6O88572 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrp6O88572 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrp6O88572 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrp6O88572 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrp6O88572 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrp6O88572 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrp6O88572 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrp6O88572 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrp6O88572 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrp6O88572 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp6O88572 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp6O88572 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms